Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurod1Q60867 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms