Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM5

Miga1, Mitoguardin 1, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Miga1Q4QQM5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Miga1Q4QQM5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms