Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms