Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms