Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Hdgfl2Q3UMU9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Hdgfl2Q3UMU9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Hdgfl2Q3UMU9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Hdgfl2Q3UMU9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hdgfl2Q3UMU9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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