Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDN3

Gm45902, Predicted gene 45902, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45902Q3UDN3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm45902Q3UDN3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms