Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
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Gtpbp6Q3U6U5 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Gtpbp6Q3U6U5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
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Gtpbp6Q3U6U5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
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Gtpbp6Q3U6U5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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Gtpbp6Q3U6U5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms