Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc102aQ3TMW1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms