Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms