Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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