Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms