Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdk18Q04899 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms