Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms