Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RykQ01887 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RykQ01887 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RykQ01887 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RykQ01887 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RykQ01887 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RykQ01887 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RykQ01887 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RykQ01887 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RykQ01887 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RykQ01887 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RykQ01887 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RykQ01887 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RykQ01887 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RykQ01887 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RykQ01887 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RykQ01887 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RykQ01887 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RykQ01887 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RykQ01887 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RykQ01887 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RykQ01887 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RykQ01887 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RykQ01887 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RykQ01887 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RykQ01887 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RykQ01887 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RykQ01887 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RykQ01887 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RykQ01887 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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