Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms