Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms