Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pde1bQ01065 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pde1bQ01065 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pde1bQ01065 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pde1bQ01065 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pde1bQ01065 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pde1bQ01065 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pde1bQ01065 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pde1bQ01065 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pde1bQ01065 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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