Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms