Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx1P63006 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms