Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms