Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ufm1P61961 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ufm1P61961 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ufm1P61961 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ufm1P61961 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms