Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf3P61205 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms