Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms