Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fgd1P52734 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms