Protein–RNA interactions for Protein: P51827

Aff3, AF4/FMR2 family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff3P51827 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aff3P51827 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aff3P51827 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aff3P51827 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms