Protein–RNA interactions for Protein: P50711

Defa13, Alpha-defensin 13, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa13P50711 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa13P50711 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa13P50711 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms