Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpdP50404 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpdP50404 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpdP50404 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms