Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdhaP50136 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms