Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms