Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms