Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
VdrP48281 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
VdrP48281 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
VdrP48281 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VdrP48281 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VdrP48281 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms