Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Epb41P48193 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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