Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TgfaP48030 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TgfaP48030 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TgfaP48030 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TgfaP48030 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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