Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lig1P37913 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lig1P37913 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lig1P37913 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms