Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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