Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd12P23812 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms