Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms