Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P20040 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
P20040 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P20040 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P20040 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P20040 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P20040 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P20040 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P20040 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P20040 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P20040 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P20040 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P20040 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
P20040 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P20040 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P20040 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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