Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms