Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gata1P17679 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gata1P17679 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms