Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RhoP15409 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RhoP15409 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RhoP15409 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RhoP15409 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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