Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms