Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FosbP13346 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FosbP13346 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FosbP13346 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FosbP13346 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FosbP13346 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FosbP13346 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FosbP13346 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FosbP13346 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FosbP13346 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FosbP13346 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FosbP13346 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FosbP13346 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FosbP13346 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FosbP13346 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FosbP13346 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FosbP13346 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FosbP13346 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FosbP13346 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FosbP13346 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FosbP13346 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FosbP13346 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FosbP13346 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FosbP13346 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FosbP13346 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FosbP13346 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FosbP13346 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FosbP13346 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FosbP13346 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms