Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm1P12657 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm1P12657 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm1P12657 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm1P12657 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm1P12657 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm1P12657 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chrm1P12657 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm1P12657 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm1P12657 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm1P12657 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm1P12657 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm1P12657 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chrm1P12657 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chrm1P12657 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm1P12657 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm1P12657 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm1P12657 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm1P12657 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm1P12657 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm1P12657 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm1P12657 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm1P12657 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms