Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtcP11725 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtcP11725 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtcP11725 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms