Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms