Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TnfP06804 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TnfP06804 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TnfP06804 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TnfP06804 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TnfP06804 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TnfP06804 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnfP06804 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnfP06804 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnfP06804 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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