Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Me1P06801 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Me1P06801 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Me1P06801 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Me1P06801 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Me1P06801 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Me1P06801 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Me1P06801 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Me1P06801 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Me1P06801 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Me1P06801 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Me1P06801 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Me1P06801 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Me1P06801 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Me1P06801 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Me1P06801 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Me1P06801 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Me1P06801 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Me1P06801 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Me1P06801 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Me1P06801 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Me1P06801 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Me1P06801 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Me1P06801 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Me1P06801 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Me1P06801 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Me1P06801 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Me1P06801 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Me1P06801 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Me1P06801 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Me1P06801 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms