Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CrygdP04342 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
CrygdP04342 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms