Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BckdkO55028 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BckdkO55028 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
BckdkO55028 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BckdkO55028 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BckdkO55028 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BckdkO55028 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
BckdkO55028 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BckdkO55028 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BckdkO55028 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BckdkO55028 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
BckdkO55028 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BckdkO55028 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BckdkO55028 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
BckdkO55028 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms